TreeBASE è un deposito di dati filogenetici pubblicati in riviste scientifiche. Negli studi di filogenetica, i dati di ricerca sono raccolti o genetai come osservazioni comparative (es.: matrici di stato del carattere o allineamenti multipli in sequenza) create in un insieme di taxa, metadati sui taxa, e gli alberi filogenetici che sono afferenti alla migliore descrizione delle relazioni evolutive tra i taxa.
La filogenesi (non comune filogenia) è il processo di ramificazione delle linee di discendenza nell'evoluzione della vita. La sua ricostruzione è fondamentale per la sistematica, che appunto si propone di ricostruire le relazioni di parentela evolutiva tra gruppi tassonomici (a qualunque livello sistematico) di organismi.
