Pfam

Pfam è un database di famiglie di proteine che include le loro annotazioni e gli allineamenti di sequenze multiple generati usando i modelli di Markov nascosti.

6 relazioni: Algoritmo, Base di dati, Modello di Markov nascosto, Protein Data Bank, Proteopedia, Struttura proteica.

Algoritmo

Un algoritmo è un procedimento che risolve un determinato problema attraverso un numero finito di passi elementari in un tempo ragionevole.

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Con base di dati o banca dati (a volte abbreviato con la sigla DB dall'inglese data base) in informatica si indica un insieme di dati, omogeneo per contenuti e per formato, memorizzati in un elaboratore elettronico e interrogabili via terminale utilizzando le chiavi di accesso previste.

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Modello di Markov nascosto

Transizioni di stato in un modello di Markov nascosto (esempio) ''x'' — stato nascosto ''y'' — uscita osservabile ''a'' — probabilità di transizione ''b'' — probabilità di uscita Un modello di Markov nascosto (Hidden Markov Model - HMM) è una catena di Markov in cui gli stati non sono osservabili direttamente.

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Protein Data Bank

Il Protein Data Bank (PDB) è un archivio per dati di struttura in 3-D di proteine e acidi nucleici.

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Proteopedia

La Proteopedia è una enciclopedia online delle proteine e di altre molecole, presentate anche con immagini tridimensionali, che è facile da modificare dai suoi stessi utenti perché si serve del software Mediawiki.

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Struttura proteica

Le proteine sono catene di amminoacidi costituite da 20 L-α-amminoacidi diversi, denominati anche residui, che si ripiegano in strutture tridimensionali uniche.

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