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Esonucleasi

Indice Esonucleasi

Le esonucleasi sono enzimi che idrolizzano il mRNA iniziando la loro azione da un'estremità libera e procedendo gradualmente lungo la catena polinucleotidica, liberando un singolo nucleoside monofosfato per volta.

Indice

  1. 22 relazioni: Accoppiamento del lievito, Assemblaggio Gibson, Complesso DNA polimerasi α-primasi, Desossiribonucleasi, DNA, DNA clamp, DNA polimerasi (DNA-dipendente), Endonucleasi, Filamento lagging, Fomivirsen, Frammento di Klenow, Maturazione dell'mRNA, Mobiloma, Nick translation, Nucleasi, Primer, Recombineering, Replicazione del DNA, Rivestimento in 5', Senso (biologia molecolare), TaqMan, Yaravirus brasiliensis.

Accoppiamento del lievito

Il lievito (Saccharomyces cerevisiae) è un semplice organismo unicellulare eucariotico che può esistere sia in forma aploide che in forma diploide.

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Assemblaggio Gibson

L'assemblaggio Gibson® (in inglese Gibson assembly®) è un approccio di clonaggio che consente di unire tra loro vari frammenti di DNA in un'unica reazione isotermica.

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Complesso DNA polimerasi α-primasi

La Dna polimerasi α/primasi è un complesso proteico eucariotico composto da quattro subunità (p49, p58, p70 e p180) che, sintetizzando un primer (innesco) di RNA, permette l'inizio della replicazione del DNA.

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Desossiribonucleasi

Vengono definiti desossiribonucleasi (o anche DNasi) tutti quegli enzimi appartenenti alla classe delle transferasi che catalizzano la reazione di idrolisi dei legami fosfodiesterici dei desossiribonucleotidi, permettendo così la liberazione di mononucleotidi.

Vedere Esonucleasi e Desossiribonucleasi

DNA

Lacido desossiribonucleico o deossiribonucleico (sigla DNA, dall'inglese DeoxyriboNucleic Acid) è l'acido nucleico che contiene le informazioni genetiche per lo sviluppo, l'omeostasi e la riproduzione di tutti gli esseri viventi conosciuti.

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DNA clamp

Con il termine DNA clamp o sliding clamp, vengono identificate una serie di proteine che assolvono la funzione di fattori di promozione o di fattori di processamento nella replicazione del DNA.

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DNA polimerasi (DNA-dipendente)

Le DNA polimerasi (DNA-dipendente) sono enzimi appartenenti alla categoria delle transferasi, che catalizzano la seguente reazione: deossinucleoside trifosfato + DNAn ⇄ difosfato + DNAn+1.

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Endonucleasi

Le endonucleasi sono enzimi idrolitici identificati negli anni settanta, che scindono il legame fosfodiesterico all'interno di una catena polinucleotidica, dividendola in due polimeri, a differenza delle esonucleasi che ne distaccano il nucleotide terminale.

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Filamento lagging

Il filamento lagging, o filamento ritardato, è la copia di DNA sintetizzata sullo stampo che ha direzione 3'5'. Questa catena polinucleotidica, quindi, avendo direzione 3'5', opposta a quella della forcella di replicazione, non potrà essere sintetizzata in maniera continua, ma sotto forma di corti frammenti, detti frammenti di Okazaki, ognuno dei quali inizia in corrispondenza dell'estremità OH-3' libera di un primer di RNA.

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Fomivirsen

Fomivirsen (in fase sperimentale noto con la sigla ISIS 29229) è un oligonucleotide fosforotioato (cioè contenente un legame fosforo-zolfo al posto del legame fosforo-ossigeno), una molecola dotata di attività antivirale sviluppata dalla società Ionis Pharmaceuticals.

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Frammento di Klenow

Il Frammento di Klenow è un enorme frammento proteico prodotto quando la DNA polimerasi I di Escherichia coli subisce clivaggio enzimatico da parte della proteasi subtilisina.

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Maturazione dell'mRNA

La maturazione dell'mRNA (o maturazione dell'RNA) consiste in una serie di processi chimici che trasformano una molecola di pre-mRNA (trascritto primario) in RNA messaggero (mRNA).

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Mobiloma

Il mobiloma comprende tutti gli elementi genetici mobili di una cellula, i quali possono muoversi all'interno o tra genomi diversi. A seconda del meccanismo con cui si spostano e al tipo di sequenza, tali elementi possono essere suddivisi in diverse categorie: elementi trasponibili, plasmidi, batteriofagi e ribozimi auto-splicing.

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Nick translation

Il metodo della Nick translation è una tecnica di laboratorio di biologia molecolare che serve per operare la marcatura del DNA ovvero a creare sonde radioattive che potranno servire in seguito per esperimenti quali ad esempio il sequenziamento di un tratto di acido nucleico.

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Nucleasi

Una nucleasi è un enzima capace di idrolizzare i legami fosfodiestere fra le subunità nucleotidiche degli acidi nucleici. Le nucleasi vengono anche chiamate, secondo la vecchia terminologia, polinucleotidasi o nucleodepolimerasi.

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Primer

Un primer è una breve sequenza di acidi nucleici, utilizzata per dare inizio alla replicazione del DNA. In natura, generalmente, è l'RNA che viene usato come primer, perché le DNA polimerasi (enzimi che catalizzano la duplicazione del DNA) non sono in grado di iniziare la sintesi di una nuova catena senza ricorrere ad un innesco.

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Recombineering

Recombineering (da recombination engineering, ingegneria di ricombinazione) è una tecnica di modificazione del DNA basata sulla ricombinazione omologa dell'Escherichia coli.

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Replicazione del DNA

Nella biologia molecolare, la replicazione del DNA è il processo biologico di produzione di due repliche di una molecola di DNA identiche all'originale.

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Rivestimento in 5'

Il rivestimento in 5' (anche cappuccio in 5, o 5' cap all'inglese) è un nucleotide alterato speciale sull'estremità 5' dell'RNA messaggero precursore e altri trascritti primari di RNA trovati negli eucarioti.

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Senso (biologia molecolare)

In biochimica, il concetto di senso si riferisce all'orientamento estremità-estremità di un singolo filamento di acido nucleico. Le convenzioni di nomenclatura degli anelli di zucchero contenuti nei nucleotidi hanno come diretta conseguenza la presenza di estremità 5′ ed estremità 3′.

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TaqMan

TaqMan è il nome di una serie di sonde utilizzate per aumentare la specificità della real time PCR. Il metodo, descritto per la prima volta nel 1991, si basa sull'utilizzo di un oligonucleotide marcato con un fluoroforo a una estremità mentre nell'altra estremità è presente un quencher.

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Yaravirus brasiliensis

Yaravirus brasiliensis è un virus parassita di una specie di ameba, la sua scoperta è stata resa nota a febbraio 2020. Lo Yaravirus ha dimensioni dell'ordine dei 80 nm (poco meno di 1/10.000 di millimetro) e ha 44.924 coppie di basi dsDNA (dsDNA è la sigla inglese per double stranded DNA, in italiano doppia elica del DNA).

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