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Bioclipse

Indice Bioclipse

Bioclipse è un progetto open source basato su Java, una piattaforma visuale per la chemioinformatica e la bioinformatica basata su Eclipse Rich Client Platform (RCP).

Indice

  1. 18 relazioni: Bioinformatica, Chemioinformatica, Chemistry Development Kit, Eclipse IDE, Eclipse Public License, Front-end e back-end, Interfaccia grafica, Istituto europeo di bioinformatica, Java (linguaggio di programmazione), Jmol, Linguaggio di scripting, Multipiattaforma, Open source, Plugin (informatica), Software, Università di Leida, Università di Uppsala, 2010.

  2. Chemioinformatica

Bioinformatica

La bioinformatica è una disciplina scientifica dedicata alla risoluzione di problemi biologici a livello molecolare con metodi informatici.

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Chemioinformatica

La chemioinformatica è l'uso del computer e delle tecniche dell'informazione, applicate ad una serie di problemi nel campo della chimica. Queste tecniche in silico sono usate dalle compagnie farmaceutiche nel processo di scoperta dei nuovi farmaci.

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Chemistry Development Kit

Chemistry Development Kit, CDK, è una libreria Java open source per la chemioinformatica e la bioinformatica. È disponibile per sistemi Windows, macOS, Linux e Unix.

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Eclipse IDE

Eclipse IDE è un ambiente di sviluppo integrato multi-linguaggio e multipiattaforma. Ideato da un consorzio di grandi società quali Ericsson, HP, IBM, Intel, MontaVista Software, QNX, SAP e Serena Software, chiamato Eclipse Foundation.

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Eclipse Public License

La Eclipse Public License (EPL) è una licenza libera utilizzata da Eclipse Foundation per il suo software Eclipse. Sostistuisce la Common Public License (CPL) eliminando alcuni termini relativi a contenziosi in materia di brevetti.

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Front-end e back-end

I termini inglesi front end (in sigla FE) e back end (in sigla BE) (anche scritti, frontend o front-end e backend o back-end) in informatica denotano, rispettivamente, la parte visibile all'utente di un programma e con cui egli può interagire —tipicamente un'interfaccia utente— e la parte che permette l'effettivo funzionamento di queste interazioni.

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Interfaccia grafica

Linterfaccia grafica, nota anche come GUI (dall'inglese graphical user interface), in informatica è un tipo di interfaccia utente che consente l'interazione uomo-macchina in modo visuale utilizzando rappresentazioni grafiche (es. widget) piuttosto che utilizzando i comandi tipici di un'interfaccia a riga di comando (vedi shell e front end): cominciata ad apparire negli anni ottanta, tra i primi esempi il Macintosh 128K di Apple, presentato nel gennaio 1984, anche se limitata dal monitor in bianco e nero, nel gennaio del 1985 Atari Corporation aveva presentato l'Atari ST, anche se l'interfaccia grafica era monocromatica.

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Istituto europeo di bioinformatica

L'Istituto europeo di bioinformatica (EBI dall'inglese European Bioinformatics Institute), che fa capo al Laboratorio Europeo di Biologia Molecolare (EMBL), è un centro di ricerca e servizi di bioinformatica.

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Java (linguaggio di programmazione)

In informatica Java è un linguaggio di programmazione ad alto livello, orientato agli oggetti e a tipizzazione statica, che si appoggia sull'omonima piattaforma software di esecuzione, specificamente progettato per essere il più possibile indipendente dalla piattaforma hardware di esecuzione (tramite compilazione in bytecode prima e interpretazione poi da parte di una JVM) (sebbene questa caratteristica comporti prestazioni in termini di computazione inferiori a quelle di linguaggi direttamente compilati come C e C++ ovvero dunque perfettamente adattati alla piattaforma hardware).

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Jmol

Jmol è un visualizzatore open source che permette di visualizzare le strutture molecolare in 3D: mostra una rappresentazione in 3D di una molecola che può essere utilizzata come strumento di insegnamento, o in campi di ricerca quali chimica e biochimica.

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Linguaggio di scripting

Un linguaggio di scripting, in informatica, è un linguaggio di programmazione interpretato destinato in genere a compiti di automazione del sistema operativo (batch) o delle applicazioni (macro), o a essere usato nella programmazione web all'interno delle pagine web.

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Multipiattaforma

Il termine multipiattaforma in informatica può essere riferito ad un linguaggio di programmazione, ad un'applicazione software o ad un dispositivo hardware che funziona su più di un sistema o appunto, piattaforma (es. Unix/Linux, Windows e Macintosh).

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Open source

Con open source (in italiano sorgente aperta), in informatica, si indica un software distribuito, generalmente in via gratuita, sotto i termini di una licenza open source, che ne concede lo studio, l'utilizzo, la modifica e la redistribuzione.

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Plugin (informatica)

Il plugin (in italiano componente aggiuntivo) in campo informatico è un programma non autonomo che interagisce con un altro programma per ampliarne o estenderne le funzionalità originarie (ad es. un plugin per un software di grafica permette l'utilizzo di nuove funzioni non presenti nel software principale): possono essere utilizzati non solo su software, ma anche su qualunque cosa che possa essere visitata da chiunque, quindi pubblica (ad es.

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Software

Il software, in informatica ed elettronica, indica (per un sistema informatico) l'insieme delle componenti intangibili di elaborazione. Il significato è contrapposto a quello di hardware, che corrisponde alla parte materiale (strato fisico/tangibile) del detto sistema.

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Università di Leida

L'Università di Leida (in olandese Universiteit Leiden, Academia Lugduno-Batava in latino) è la più antica università dei Paesi Bassi, situata nella città di Leida.

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Università di Uppsala

L'Università di Uppsala (in svedese: Uppsala universitet) è un'università pubblica di ricerca situata ad Uppsala, in Svezia. Fondata nel 1477, è la più antica università della Scandinavia.

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2010

È stato dichiarato dalle Nazioni Unite Anno Internazionale della biodiversità e proclamato dal Parlamento europeo Anno della lotta alla povertà e all'esclusione sociale.

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Vedi anche

Chemioinformatica